АО "Корпорация "ВНИИЭМ" представляет собой многопрофильное предприятие, в структуру которого входят научно-производственные комплексы и центры:
- научно-производственный комплекс «Космические комплексы»;
- научно-производственный комплекс «Космическая и комплексная силовая электромеханика»;
- научно-производственный комплекс «Электрооборудование и системы управления для АЭС»;
- научно-технический комплекс «Качество, научно-техническое и информационное обеспечение»;
- научно-производственный центр корабельного электромашиностроения;
- центр поддержки технологии и качества;
- центр инновационных технологий.
Основными направлениями деятельности предприятия являются разработка и создание: космических комплексов и автоматических космических аппаратов, предназначенных для гидрометеорологического, природно-ресурсного и экологического мониторинга Земли, мониторинга техногенных и чрезвычайных природных катастроф, картографии; электромеханического оборудования для малых космических аппаратов различного назначения, в том числе аппаратуры для космических автоматических аппаратов и орбитальных станций; электрооборудования, систем управления и защиты ядерных реакторов АЭС, автоматизированных систем контроля и управления электрооборудованием и средств управляющей вычислительной техники; продукции электромашиностроения, в том числе разработка специальных электромашин и электродвигателей малой мощности; систем и электрооборудования для флота; специальных электромеханических устройств для газовой и нефтеперерабатывающей промышленности; медицинских аппаратов и оборудования.
АО "Корпорация "ВНИИЭМ" входит структуру ГК "Роскосмос".